Насколько я знаю, вы совершенно правы. То, что это "наш" атомизм, я заключаю по критерию непрерывности: вроде бы это именно непреррывная традиция использования этой мысли. Но всех деталей я не знаю, обычно атомизм в Европе рассматривают примерно с Гассенди, а до того умалчивают. Кто именно изменил традиционную арабскую трактовку мимолетных атомов на более нам привычную - не знаю. Однако, вспоминая то, что читал у Смирнова про арабский способ мышления, могу предположить - для них именно такой атомизм является не специально изобретенным, а естественым, вытекающим из общих мировоззренческих оснований культуры. Как для Европы естественно выделять "объект и фон", и мыслить атомы постоянными, а тогда уж на них легко ложится бремя причинности.